Jedno z jeho posledných prianí však bolo zomrieť v pokoji domova a obklopený milujúcou rodinou. Keď cítil, že sa blíži jeho koniec, vrátil sa do svojej vily. V spoločnosti najbližších v pondelok večer boj zo zákernou rakovinou prehral. Tesne pred smrťou však rozmýšľal, že svoje utrpenie ukončí samovraždou.
Posledné mesiace života, keď bolo utrpenie z rakoviny neznesiteľné, myslel Bořivoj Navrátil na samovraždu čoraz častejšie. „Chcel by som to ukončiť, ale nemôžem si siahnuť na život. V našej rodine došlo už k trom samovraždám, ja by som bol štvrtý,“ povedal na sklonku života Navrátil. Aj v takých ťažkých chvíľach, aké prežíval, myslel viac na svoju rodinu ako na seba. „Nemôžem dopustiť, aby si môj syn myslel, že sme nejako poznačená rodina.“
Okrem toho, že musel bojovať sám so sebou, riešil aj problémy iných. V nemocnici sa mu ľudia na onkológii zdôverovali so svojimi tajnými túžbami, ale aj s bolesťou, ktorú prežívali. Na izbe ležal Navrátil s tridsaťročným mužom, ktorý si prial jediné - smrť. Bol oslabený a nemal silu ďalej pokračovať. Bál sa krutej bolesti a pomalej smrti. „Pýtal sa ma, ako si má zobrať život,“ prezradil tesne pred smrťou českému Blesku Navrátil. Keď u neho choroba prepukla naplno, začal čoraz viac myslieť na svojho kolegu Vlastimila Brodského († 81), ktorý si tiež zvolil dobrovoľný odchod zo sveta, keď začal mať strach, že bude na ťarchu. Česká legenda však od takejto možnosti upustila hlavne kvôli rodine a svojmu synovi Kryštofovi. „Môj otec sa po smrti mamičky zastrelil. Ja však utiecť nemôžem,“ zveril sa Bořivoj pár týždňov pred smrťou.
Navrátil sa stal známym ako herec Národného divadla. Účinkoval vo viac ako stovke inscenácií. Medzi jeho najznámejšie úlohy patrili postava predsedu Svetovej rady v Návštevníkoch a tiež úloha vo filme Knoflikáři. Naposledy účinkoval v českom úspešnom seriáli Ulica.
