Za prebiehajúci proces vyraďovania je zodpovedná Jadrová vyraďovacia spoločnosť (JAVYS). "V prípade zlyhania tohto projektu musí JAVYS, a. s., počítať s rizikom čiastočných alebo úplných finančných korekcií, ktoré bude musieť znášať Slovenská republika," upozornil NKÚ na možnosť vrátenia prostriedkov poskytnutých Európskou úniou.
Kontrolóri upozornili aj na údajne nefunkčný vnútorný kontrolný systém spoločnosti JAVYS, pasivitu dozornej rady spoločnosti a riziká spojené s financovaním vyraďovania jadrových zariadení z národných zdrojov v budúcich desaťročiach. "Na druhej strane pozitívom je fakt, že súčasné vedenie spoločnosti už počas výkonu auditu prijímalo opatrenia posilňujúce všetky úrovne vnútornej kontroly," skonštatoval NKÚ.
V súvislosti s národným financovaním priamych aj nepriamych nákladov vyraďovania je podľa NKÚ nevyhnutné stanoviť záväzok pridelenia adekvátnych finančných zdrojov v dlhodobom časovom horizonte, brať do úvahy aj predpoklad zvýšenia podielu národného spolufinancovania, riziká spojené s prípadnými finančnými korekciami, ako aj znášanie DPH ako neoprávneného výdavku. "Jadrová bezpečnosť je mimoriadne dôležitá. Keďže ide o projekty za niekoľko miliárd eur na najbližších niekoľko desaťročí, štát musí začať efektívne plánovať ich postupné finančné krytie," povedal predseda NKÚ Ľubomír Andrassy.
