Na základe výzvy potom budú môcť záujemcovia podať žiadosť o poskytnutie prostriedkov mechanizmu plánu obnovy. "Na základe posúdenia žiadosti o prostriedky mechanizmu vykonávateľ identifikuje tie žiadosti, ktoré splnili podmienky poskytnutia prostriedkov mechanizmu a žiadosti, ktoré nesplnili podmienky poskytnutia prostriedkov mechanizmu," skonštatovali autori materiálu s tým, že zo žiadostí, ktoré splnili podmienky, sa potom vytvorí rebríček v závislosti od najlepšie splnených kritérií alebo od najskoršie doručenej úplnej žiadosti.
Proti posúdeniu je možné podávať aj písomné námietky, to treba urobiť do šiestich pracovných dní od doručenia oznámenia o nesplnení podmienok. Ak sú podmienky splnené a rozhodne sa o poskytnutí prostriedkov, pristupuje sa k dohode na zmluve.
Materiál spresňuje aj princípy finančného riadenia plánu obnovy. Píše o priebežnom financovaní aj o predbežných platbách z rozpočtu EÚ a o zaradení prostriedkov EÚ do štátneho rozpočtu. Spresňuje aj spôsob, ako sa budú peniaze poskytovať vykonávateľovi a či budú možné presuny. Materiál ošetruje realizáciu platieb, systém financovania aj systém predfinancovania a zálohových platieb či refundácie.
Autori materiálu tiež zdôraznili, že EK má právo primerane znížiť podporu v rámci mechanizmu v prípade podvodu, korupcie, konfliktu záujmov či dvojitého financovania alebo pri závažnom porušení povinnosti vyplývajúcej z uzatvorených dohôd.
Materiál spresňuje aj pravidlá vedenia a uchovávania záznamov. Takisto sa v ňom píše aj o monitorovaní a podávaní pravidelných správ. Spomínajú sa aj pravidlá kontroly implementácie, ktorú budú takisto vykonávať NIKA a vykonávateľ.
Štát sa bude pri pláne obnovy zaoberať aj posúdením rizík, prijme opatrenia proti podvodom, korupcii a konfliktu záujmov na úrovni vykonávateľa. V materiáli sa píše aj o komunikácii a koordinácii implementácie peňazí z plánu obnovy. Štát chce zvýšiť povedomie o prioritách plánu obnovy, pričom jedným z nástrojov je webové sídlo www.planobnovy.sk.