Křen bol v roku 1970 kvôli nesúhlasu so vstupom vojsk Varšavskej zmluvy vylúčený z komunistickej strany a ako disident a signatár Charty 77 sa podieľal na príprave bytových seminárov podzemnej univerzity. Od prezidenta Václava Havla v roku 2002 dostal medailu Za zásluhy.
Vladimír Křen uviedol, že jeho otec v utorok zomrel na infekčnom oddelení Nemocnice na Bulovce s chorobou covid-19, ktorú spôsobuje nový typ koronavírusu. Do nemocnice bol prevezený z domova pre seniorov v Michli, kde sa nákaza objavila na konci marca. Zdroj z magistrátu, ktorý je dobre oboznámený so situáciou, v pondelok ČTK povedal, že na ochorenie zomrelo šesť klientov domova a viac než 30 ďalších je koronavírusom nakazených.
Křen ako mladý po druhej svetovej vojne vstúpil do KSČ, na prelome 40. a 50. rokov vyštudoval históriu. Do roku 1970 pôsobil ako vedúci katedry histórie na Vysokej škole politickej a na Filozofickej fakulte Univerzity Karlovej. Venoval sa štúdiu dejín prvej republiky, KSČ a československého odboja počas druhej svetovej vojny.
V čase uvoľnenia v 60. rokoch sa ako jeden z prvých českých historikov začal venovať téme odsunu Nemcov z Československa po druhej svetovej vojne. Po vylúčení z KSČ pracoval ako robotník, patrí k zakladateľom samizdatových Historických studií.
V 80. rokoch Křenovi v exilovom nakladateľstve Sixty-Eight Publishers prvýkrát vyšla jedna z jeho hlavných prác Konfliktní společenství Česi a Nemci 1780-1918. Neskôr bola vydaná aj v Nemecku. Za svoju knihu Dve storočia strednej Európy bol Křen v roku 2006 ocenený cenou Magnesia Litera v kategórii náučnej literatúry.
Po revolúcii v roku 1989 patril Křen k zakladateľom Inštitútu medzinárodných štúdií novozaloženej Fakulty sociálnych vied Univerzity Karlovej a bol jeho prvým riaditeľom. Bol tiež jedným z iniciátorov založenia a predsedom Česko-nemeckej komisie historikov, angažoval sa v Česko-nemeckom fonde budúcnosti.
Ako hosťujúci profesor pôsobil na univerzitách v Brémach, Berlíne a Marburgu. V roku 2000 dostal Veľký kríž za zásluhy Rádu za zásluhy Spolkovej republiky Nemecko.
