Zdravotné problémy začal mať vtedy, keď sa prevalili škandály okolo financovania Katolíckej univerzity, na ktoré sám upozornil. Z univerzity vyhodil ľudí, ktorí boli za to zodpovední.
Smrť katolíckeho kňaza, ktorý sa narodil v Poľsku, potvrdil pre Aktuality.sk bývalý prorektor univerzity Peter Olekšák. „Bol to dobrý muž, kňaz, profesor a mučeník pravdy,“ povedal s tým, že Zasepu pochovajú v Ružomberku zrejme najbližšiu nedeľu. Práve Zasepa sa nebál prehovoriť a už ako rektor vytiahol na svetlo sveta informácie o finančných machináciách na univerzite. Chcel, aby sa tam vykonala dôkladná audítorská kontrola. Ľudia sa tak dozvedeli aj o obrovských odmenách, keď si poltucet zamestnancov univerzity rozdelil až 114-tisíc eur. Akademický senát sa Zasepu preto pokúsil hneď dvakrát neúspešne odvolať.
Postavili sa však za neho absolventi a nakoniec sa sám vzdal funkcie pre zdravotné problémy. V roku 2015 mu začalo zlyhávať srdce a niekoľkokrát sa pred priateľmi vyjadril, že mu ho zlomili slovenskí katolícki biskupi. Lekári mu povedali, že ak nepodstúpi transplantáciu, zomrie o pár minút. Napokon dostal umelé srdce. Medzinárodne uznávaný profesor bol minulý rok hospitalizovaný na koronárnej jednotke Fakultnej nemocnice v Prešove. Bol napojený na prístroje, ťažko dýchal a z očí mu padali slzy. Napriek tomu redaktorke Nového Času s obrovskou láskou povedal. ,,Som veľmi slabý, ale obklopený láskou ľudí, ktorí mi dôverujú a ktorým verím.“ S obrovskou vierou v srdci odišiel minulú nedeľu aj na druhý svet.
