Tento druh transplantácie patrí podľa odborníkov medzi najkomplikovanejšie, čo súvisí s viacerými faktormi. Na jednej strane má mnoho pacientov za sebou už viacero chirurgických zákrokov v brušnej dutine, čo znamená množstvo zrastov a zmenšenú prístupnosť, na strane druhej je tenké črevo významným imunitným orgánom v ľudskom tele, čo predstavuje hrozbu silnej reakcie na darované tkanivo.
Špecialisti z IKEM-u, ktorí iba nedávno informovali, že v spolupráci s kolegami z Fakultnej nemocnice v Prahe-Motole realizovali unikátnu "dvojtransplantáciu" srdca a pľúc u 34-ročného muža sužovaného cystickou fibrózou, sa podľa dostupných informácií pripravovali na transplantáciu tenkého čreva niekoľko rokov.