Teraz dostal vyhadzov aj z funkcie šéfa Kompetenčného centra finančných operácií. O ten sa mu postarala poverená riaditeľka Finančnej správy Mária Machová, ktorá nahradila Igora Krnáča. Dôvodom personálnych výmen je nefunkčný nový daňový informačný systém. Nepomohlo ani to, že Mikulčík je priateľom ministra financií Ivana Mikloša, s ktorým pravidelne trávi aj dovolenky.
Machová avizovala Mikulčíkovo odvolanie už pri preberaní funkcie. Ku konkrétnemu kroku pristúpila v piatok, lebo do konca týždňa mal preukázať výrazný pokrok v nasadení a používaní nového informačného systému. „Vzhľadom na postavenie a zodpovednosť riaditeľa Kompetenčného centra finančných informácií v tomto projekte bolo racionálne ho v danej funkcii do konca pracovného týždňa ponechať,“ vysvetlila Machová. Poverená šéfka Finančnej správy SR pripomenula, že proti Mikulčíkovi mala výhrady už v čase, keď sa rozhodla prijať ponuku viesť finančnú správu. Upozornila na to aj ministra financií Ivana Mikloša, ktorý je osobným priateľom Igora Mikulčíka. „Informovala som ho, že zotrvanie pána Mikulčíka na poste riaditeľa Kompetenčného centra finančných operácií nepovažujem za možné,“ uviedla Machová. Prekážala jej najmä nedostatočná príprava prechodu na nový systém. „Najmä nezaškolenie ľudí na nové podmienky práce,“ uzavrela Machová.
Minister financií Ivan Mikloš Machovej rozhodnutie akceptuje, aj keď v minulosti sa o Mikulčíkovi vyjadroval ako o kvalitnom manažérovi. Zastával sa ho aj v čase vlaňajšej kauzy s prenájmom budovy pre košických daniarov. Spornú zákazku mal vtedy získať predstaviteľ SDKÚ Ondrej Ščurka.